研究所作为核心战略建筑之一，其叠加机制直接影响玩家策略选择。根据现有资料，研究所的叠加效果存在明确规则，但需结合建筑等级、卡片研发优先级及地图布局综合考量。研究所的核心功能是研发特殊卡片，包括机器工人卡、遥控骰子卡、传送卡和核弹卡等。多个研究所能否叠加生效取决于等级条件：只有全部研究所均升至5级时，研发效果才会叠加。低等级研究所无法提供额外收益，且研发时间独立计算。这一机制要求玩家在资源分配上做出权衡，优先集中升级单一研究所或分散投资多个建筑。
关于研究所与其他建筑的协同效应，石油公司、证券中心等大型建筑常被列为优先建造目标。但需注意，研究所的防御能力较弱，易被对手用购地卡或怪兽卡拆除。部分玩家认为研究所应建在偏僻地块以减少被攻击风险，而另一观点主张将其置于核心地段以便快速升级。土地庙的加成计算方式（逐级累加而非乘积）同样适用于研究所的租金收益，但对其研发功能无直接影响。
在热斗模式中，研究所的战术价值有所下降。该模式以卡片攻击为主，且大型建筑不受爆炸影响，研究所的研发优势被削弱。更推荐优先建造饭店或购物中心等能直接限制对手行动的防御型建筑。传统模式下，研究所仍是中后期关键，尤其是核弹卡和传送卡可逆转战局。
