佩恩入侵团本对忍者选择有较高要求，优先考虑技能范围广且输出稳定的角色。秽土三代、照美冥这类忍者表现突出，既能快速清场救人，也能在BOSS战中打出高额伤害。低战力玩家可以专注救人任务，选择带群体控制或AOE技能的忍者辅助团队。团队中至少需要2名高输出忍者负责关键阶段，其余成员可根据自身战力灵活调整定位。
进入战斗后分为救人、削弱BOSS、最终决战三个阶段。救人阶段建议站在两个村民中间释放土流壁等范围秘卷，一次性解救多人提升效率。面对畜生道召唤的通灵兽时，注意躲避地面红线提示的直线攻击。第二阶段需分配队伍分别击杀修罗道、畜生道和小南，高战力队伍优先处理小南，其余成员继续救人。第三阶段开局不要直接挑战天道，必须先击杀地狱道和饿鬼道削弱天道查克拉，当查克拉降至50%以下时再集火天道。
饿鬼道被蓝色泡泡包裹时会回血，必须停手等待泡泡消失。天道战需先破坏五根立柱才能造成伤害，注意队员大招不要同时释放，避免触发天道的小神罗天征造成团灭。建议采用车轮战术，高战力队伍打完两轮大招后立即撤退等CD，其他队伍持续压制查克拉。团队配合最关键的是明确分工，低战力玩家可以专注救人或压制小BOSS，为高战力玩家创造输出环境。秘卷选择上推荐土流壁抵挡直线攻击，也可携带治疗类秘卷提高容错率。走位比输出更重要，尤其要注意躲避天道的全屏技能。
